Los zapotecos se autodenominan binnisa (binni, gente; sa, nube: gente que proviene de las nubes). Para los mexicas, los zapotecos eran los zapotecatl, "gente que proviene de la región de Teozapotlán", o "lugar de los dioses". Los españoles les llamaron sencillamente zapotecos, como se les conoce en la actualidad. Los zapotecos contemplaban a sus dioses mediante la biani, luz, el cual a mediados del siglo XVII trabajaban en base a sa-biani, nube del dia.