Relacionado con el cuarzo (seixo, en gallego).
Otra teoría sobre las dos variantes de la grafía de este apellido se basa en el orígen luso del gallego actual. Esto explicaría que tanto Seijas como Seixas se pronuncien exactamente igual (seixas), siendo la versión más antigua Seijas, utilizando la grafía "j" como sonido "x" del gallego actual (que se conserva en portugués hoy en día).

Quiero aclarar que el luso o portugues tiene su origen en el gallego y no alreves.
En la reconquista, fue el reino de Galicia el que fue bajando al sur dejando su lengua a su paso.