Antiguo apellido castellano de origen toponímico, muy poco frecuente y repartido por España, si bien se registra sobre todo en la Comunidad de Madrid, en la que vive la mayor parte de las familias así apellidadas; otros notables asientos de familias Yunquera se registran en las provincias de Guadalajara, Soria, Vizcaya, Málaga y Zaragoza, y menores en las de Vizcaya, Guipúzcoa, Alicante y Sevilla, entre otras.


Procede este apellido del topónimo Yunquera (también se da en su forma Junquera), nombre de poblaciones como Yunquera (Málaga), Yunquera de Henares (Guadalajara), etc., derivado del latín –iuncos-, que hace alusión a la presencia de juncos en los terrenos sobre los que se levantaron dichas poblaciones.


El nombre de Yunquera fue adoptado como apellido por individuos que procedían de alguna de las localidades así llamadas, según fue costumbre muy extendida en la Edad Media para indicar el origen geográfico de las personas. Hubo, por tanto, distintas casas solares de Junquera, no emparentadas entre sí.


Armas.- El “Repertorio de Blasones de la Comunidad Hispánica”, tomo letras S-Z, página 1909, de don Vicente de Cadenas y Vicent, Cronista Rey de Armas contemporáneo, recoge para Yunquera, entre otros escudos de armas, el siguiente: En campo de sinople, una estaca, de oro, superada de dos estrellas, de plata, puestas en faja, y éstas, a su vez, de una lis, de oro.